Kegiatan ekstrakurikuler merupakan wadah pengembangan potensi siswa. Kegiatan ini memberikan dampak positif dalam penguatan pendidikan karakter, kreatifitas, bakat, berpikir kritis, dan semangat gotong royong.

Beberapa ekstrakulikuler yang diselenggarakan di SD Xaverius 9 Palembang adalah:

1. Pramuka
2. Volley
3. Futsal
4. Tari
5. Band
6. Taekwondo